91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5444 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  48.37 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  48.37 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  47.71 
 
 		 318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  46.65 
 
 		 318 aa  269  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  42.86 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  44.89 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  42.36 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  42.72 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  38.92 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  32.92 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  33.88 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  34.71 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  36.33 
 
 		 348 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  35.77 
 
 		 348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  35.34 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  29.97 
 
 		 476 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  29.91 
 
 		 410 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  29.17 
 
 		 365 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  29.1 
 
 		 298 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  31.29 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  27.98 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  30.2 
 
 		 439 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  27.46 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  29.97 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  28.96 
 
 		 372 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  29.93 
 
 		 342 aa  95.9  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  27.6 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.17 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  27.88 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  25.85 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  33.33 
 
 		 572 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  25.53 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  31.61 
 
 		 551 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  32.81 
 
 		 572 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  27 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  31.13 
 
 		 567 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  30.08 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  27.91 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  33.02 
 
 		 568 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  30.6 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  25.47 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  31.79 
 
 		 547 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  27.14 
 
 		 568 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  30.6 
 
 		 607 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  26.26 
 
 		 567 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  27.84 
 
 		 601 aa  69.7  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  24.26 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  27.31 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  28.27 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  24.45 
 
 		 546 aa  65.9  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  33.33 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  28.65 
 
 		 533 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  30.73 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  25.19 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  26.86 
 
 		 570 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  27.42 
 
 		 545 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  28.22 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  25.48 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  25.97 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  22.91 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  26.22 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  29.57 
 
 		 526 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  23.89 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  32.39 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  23.44 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  29.82 
 
 		 449 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  24 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  29.75 
 
 		 146 aa  53.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  24.57 
 
 		 571 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  24.6 
 
 		 605 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  26.22 
 
 		 600 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  26.25 
 
 		 343 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  26.22 
 
 		 600 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  25.79 
 
 		 433 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  31.21 
 
 		 464 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  26.67 
 
 		 449 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  33.66 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.23 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  29.13 
 
 		 384 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  25.18 
 
 		 369 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  28.37 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3452  hypothetical protein  30 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281711  normal  0.0529388 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  25.61 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  32.14 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  27.19 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  28.33 
 
 		 313 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  30.77 
 
 		 468 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  26.17 
 
 		 254 aa  43.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16690  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  33.73 
 
 		 461 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.400714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>