More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6038 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  603  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  53 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  51.51 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  50.17 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  51.18 
 
 		 307 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  48.68 
 
 		 309 aa  278  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  47.64 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  44.59 
 
 		 298 aa  262  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  46.38 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  45.64 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  40.69 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  38.72 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  36.69 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  36.27 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  35.91 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  35.08 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  35.82 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  34.97 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  35.46 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  34.98 
 
 		 296 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  30.74 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  32.21 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  32.55 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 316 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  33.01 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  33.21 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  37.42 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  35.37 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  34.66 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  43.97 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  40.82 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  42.14 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  29.57 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  31.09 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  34.65 
 
 		 451 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  27.85 
 
 		 342 aa  97.1  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  26.62 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  26.62 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  29.68 
 
 		 368 aa  96.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  26.96 
 
 		 351 aa  92.4  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  29.55 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  28.07 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  30.43 
 
 		 326 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  27.65 
 
 		 342 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  28.53 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  29.14 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  28.52 
 
 		 355 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  26.32 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  32.87 
 
 		 347 aa  87.4  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  29.69 
 
 		 313 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  26.62 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  26.69 
 
 		 355 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  31.49 
 
 		 307 aa  85.5  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  27.69 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  25.47 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  27.16 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  27.94 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.42 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  28.85 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  27.39 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  26.87 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  27.27 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  26.97 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  28.23 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  27.01 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  25.42 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  27.15 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  26.3 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  26.62 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  28.1 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  27.69 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  26.3 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  27.42 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  26.99 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  25.81 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  27.21 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  39.22 
 
 		 1010 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  26.74 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  32.97 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  27.92 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  25 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  26.48 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  28.64 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  37.12 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3656  hypothetical protein  46.99 
 
 		 132 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.954371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  26.62 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  25.68 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  26.97 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  36.36 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  29.93 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  24.91 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>