251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3871 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
313 aa  631  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  54.21 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  54.21 
 
 
313 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  54.21 
 
 
313 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  50.34 
 
 
296 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  52.16 
 
 
302 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  37.54 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  37.29 
 
 
295 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  38.21 
 
 
295 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  37.62 
 
 
295 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  35.26 
 
 
306 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  34.94 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  39.16 
 
 
296 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  38.28 
 
 
318 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  37.67 
 
 
295 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  40.4 
 
 
311 aa  165  8e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  42.11 
 
 
312 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  38.03 
 
 
308 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  36.54 
 
 
305 aa  150  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  31.79 
 
 
316 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  37.01 
 
 
321 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  34.44 
 
 
315 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  33.23 
 
 
298 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  33.99 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 
321 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 
314 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  35.71 
 
 
317 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  34.43 
 
 
299 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  32.14 
 
 
298 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  34.77 
 
 
304 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  32.69 
 
 
298 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  35.83 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  33.8 
 
 
292 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  29.41 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  39.62 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  31.86 
 
 
307 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  30.1 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  29.86 
 
 
286 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  33.96 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  28.79 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  37.5 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  34.97 
 
 
451 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  29.29 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  37.5 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  36.76 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  36.76 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  36.76 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  36.76 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  36.76 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  36.76 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  36.76 
 
 
284 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  36.76 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  36.31 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  31.69 
 
 
360 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  34.92 
 
 
292 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  34.92 
 
 
292 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  34.92 
 
 
292 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  34.13 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 
342 aa  63.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001536  hydrolases of the alpha/beta superfamily  31.21 
 
 
297 aa  63.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  29.71 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  33.33 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  29.64 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  36.23 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  29.45 
 
 
269 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  34.17 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  39.05 
 
 
490 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4281  hydrolase family protein  35.97 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.549804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  26.13 
 
 
302 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
342 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  30.97 
 
 
285 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  34.97 
 
 
313 aa  58.9  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  31.78 
 
 
278 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  28.93 
 
 
351 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  35.29 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  30.62 
 
 
282 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  32.64 
 
 
355 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  29.6 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  29.14 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  38.66 
 
 
876 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  33.04 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  31.45 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  31.36 
 
 
342 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  31.2 
 
 
355 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  31.15 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  32.5 
 
 
354 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  29.05 
 
 
355 aa  56.6  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  30.22 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  32.2 
 
 
345 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  38.61 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  32.23 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  36.45 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  37.5 
 
 
498 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  28.77 
 
 
265 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  32.26 
 
 
282 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  34.19 
 
 
258 aa  53.9  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>