83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2690 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  67.87 
 
 
498 aa  674    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  100 
 
 
498 aa  982    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  54.25 
 
 
505 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  29.9 
 
 
543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  28.38 
 
 
607 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  37.17 
 
 
568 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  29.29 
 
 
551 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  28.27 
 
 
565 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  26.04 
 
 
526 aa  104  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  27.72 
 
 
600 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  27.97 
 
 
600 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  27.47 
 
 
533 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  33 
 
 
567 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0700  hypothetical protein  34.62 
 
 
530 aa  99  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0432534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  28.93 
 
 
542 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  30.63 
 
 
568 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15401  putative dienelactone hydrolase  27.1 
 
 
531 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  24.72 
 
 
567 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1961  hypothetical protein  30.65 
 
 
524 aa  95.5  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0706  fused serine peptidase/N-terminal uncharacterized domain protein  27.1 
 
 
490 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.358194  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1058  putative dienelactone hydrolase  26.54 
 
 
516 aa  93.6  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.745735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  26.58 
 
 
605 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  29.8 
 
 
572 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  29.8 
 
 
572 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  24.93 
 
 
571 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  26.27 
 
 
546 aa  89.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11531  putative dienelactone hydrolase  26.01 
 
 
515 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  30.74 
 
 
547 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  26.52 
 
 
601 aa  87.8  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11521  putative dienelactone hydrolase  25.15 
 
 
516 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11451  putative dienelactone hydrolase  26.04 
 
 
550 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.127334  normal  0.338208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  26.63 
 
 
569 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11381  putative dienelactone hydrolase  24.92 
 
 
520 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08841  putative dienelactone hydrolase  30.9 
 
 
530 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  24.33 
 
 
545 aa  73.9  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  23.9 
 
 
570 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  31.65 
 
 
348 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  28.93 
 
 
348 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  30.8 
 
 
348 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  25.88 
 
 
312 aa  59.7  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  29.6 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  27.65 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.33 
 
 
330 aa  58.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  36.07 
 
 
340 aa  58.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  27.53 
 
 
298 aa  57.8  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  29.7 
 
 
410 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  28.87 
 
 
372 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  29.59 
 
 
346 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  29.59 
 
 
339 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  29.76 
 
 
342 aa  53.9  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  33.61 
 
 
345 aa  54.3  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  29.29 
 
 
308 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  29.59 
 
 
320 aa  50.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  29.21 
 
 
341 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  29.63 
 
 
347 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 
328 aa  49.3  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  29.51 
 
 
476 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  25.12 
 
 
373 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  27.19 
 
 
352 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  28.69 
 
 
343 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  24.79 
 
 
374 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  33.91 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  27.9 
 
 
316 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  34.11 
 
 
283 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  32.76 
 
 
266 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  30 
 
 
347 aa  47  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  27.35 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  29.38 
 
 
297 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  24.52 
 
 
376 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  32.54 
 
 
287 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.6 
 
 
350 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  26.87 
 
 
313 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  31.94 
 
 
309 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  29.63 
 
 
318 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  29.59 
 
 
328 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  29.63 
 
 
318 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  27.43 
 
 
346 aa  44.3  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
279 aa  43.9  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  29.63 
 
 
318 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  30.91 
 
 
464 aa  43.5  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  30.3 
 
 
322 aa  43.5  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  23.46 
 
 
365 aa  43.1  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>