77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5292 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  547  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  37.16 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  36.51 
 
 		 258 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  34.78 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  34.92 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  32.43 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  34.25 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  35.98 
 
 		 287 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2039  hypothetical protein  31.64 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0439547  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  30.92 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  30.04 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2475  hypothetical protein  30.77 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  29.28 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  29.17 
 
 		 253 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2666  hypothetical protein  30.56 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  36.25 
 
 		 166 aa  93.6  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 294 aa  85.5  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  27.45 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  29.08 
 
 		 524 aa  68.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7484  putative arylesterase-like protein  24.41 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  22.52 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  24.54 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  24.29 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10077  oxidoreductase  31.11 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  25.81 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  24.9 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  32.76 
 
 		 498 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3618  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  25.35 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  30.13 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0440  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.43 
 
 		 536 aa  46.6  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  34.74 
 
 		 498 aa  45.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  22.09 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  21.71 
 
 		 267 aa  45.4  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  23.49 
 
 		 259 aa  45.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 255 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  22.48 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  22.39 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  24.88 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15580  alpha/beta hydrolase family protein  25.79 
 
 		 405 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  22.09 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  24.66 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  22.09 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  22.09 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4896  hydrolase, alpha/beta fold family  24.88 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  22.09 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  22.09 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5550  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  23.94 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  24.32 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4670  alpha/beta fold family hydrolase  25.12 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  22.31 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5030  alpha/beta fold family hydrolase  25.12 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  24.42 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  32.97 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  21.62 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2627  alpha/beta hydrolase  23.38 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5169  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5258  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  24.42 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 297 aa  42.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 296 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>