39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2500 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  544  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  66.41 
 
 
258 aa  378  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  63.57 
 
 
261 aa  362  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  56.2 
 
 
261 aa  322  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  53.1 
 
 
258 aa  291  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  47.66 
 
 
266 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  34.25 
 
 
266 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  31.92 
 
 
266 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  32.57 
 
 
287 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2475  hypothetical protein  34.5 
 
 
269 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2039  hypothetical protein  30.23 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0439547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  30.53 
 
 
265 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  25.9 
 
 
257 aa  98.6  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2666  hypothetical protein  27.31 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357392  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  30.54 
 
 
166 aa  93.2  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  25.76 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  24.25 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  22.62 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7484  putative arylesterase-like protein  31.13 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  21.3 
 
 
269 aa  58.9  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  21.07 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
283 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  26.01 
 
 
524 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  24.07 
 
 
498 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43025  predicted protein  32.17 
 
 
386 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0408918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 
268 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  20.23 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1657  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 
290 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_5097  predicted protein  21.69 
 
 
282 aa  45.8  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104643  normal  0.482624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  25.44 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  25.55 
 
 
296 aa  43.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
258 aa  42.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5550  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 
281 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>