53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43025 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43025  predicted protein  100 
 
 
386 aa  800    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0408918  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_5097  predicted protein  34.72 
 
 
282 aa  146  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104643  normal  0.482624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
260 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
268 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 
297 aa  95.1  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
276 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
267 aa  90.1  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
267 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
265 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0661  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.42 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0368056  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0236  alpha/beta hydrolase fold protein  25.33 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
263 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3502  hypothetical protein  23.03 
 
 
264 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
295 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3272  hypothetical protein  25.56 
 
 
278 aa  62.8  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  22.48 
 
 
268 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  21.84 
 
 
269 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3618  alpha/beta hydrolase fold protein  23.78 
 
 
296 aa  57  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  32.17 
 
 
261 aa  53.5  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  22.71 
 
 
258 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4701  putative hydrolase protein  28.97 
 
 
280 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0255091  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0103  alpha/beta hydrolase  21.05 
 
 
277 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  29.08 
 
 
245 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  26.21 
 
 
258 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1772  lysophospholipase-like protein  23.71 
 
 
222 aa  47  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  29 
 
 
418 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  25.5 
 
 
294 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  25.5 
 
 
294 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  29 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  22.07 
 
 
262 aa  46.2  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  23.4 
 
 
261 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  30.39 
 
 
243 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
311 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  27.78 
 
 
265 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0575  hypothetical protein  27.67 
 
 
432 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  25 
 
 
653 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
237 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2013  peptidase  27.67 
 
 
441 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  29.03 
 
 
429 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3082  hypothetical protein  27.67 
 
 
442 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0393  hypothetical protein  27.67 
 
 
442 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0414  hypothetical protein  27.67 
 
 
442 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2274  hypothetical protein  27.67 
 
 
442 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  26.83 
 
 
423 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
307 aa  43.1  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  25.58 
 
 
266 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 
308 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  26.34 
 
 
423 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>