53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3272 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3272  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3502  hypothetical protein  86.64 
 
 		 264 aa  435  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  33.86 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4943  hypothetical protein  51.35 
 
 		 207 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1772  lysophospholipase-like protein  23.5 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0103  alpha/beta hydrolase  24.53 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0661  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  30.4 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0368056  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  30.08 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_5097  predicted protein  30.23 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104643  normal  0.482624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0236  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43025  predicted protein  25.56 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0408918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3618  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1657  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  25.87 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 262 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  27.17 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  28.46 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 		 260 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  22.18 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  25.64 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  22.34 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  22.6 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  31.58 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  25.57 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  27.9 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  21.74 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  33.33 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  24.22 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>