93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0642 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  100 
 
 		 262 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  29.78 
 
 		 267 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 268 aa  108  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3618  alpha/beta hydrolase fold protein  33.47 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 264 aa  89  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4701  putative hydrolase protein  28.81 
 
 		 280 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0255091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  27.76 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0236  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3502  hypothetical protein  30.74 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1657  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  25.1 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3272  hypothetical protein  30.08 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  27.45 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0661  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.94 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0368056  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  26.14 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 294 aa  75.1  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  25.3 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  23.68 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  25.93 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0103  alpha/beta hydrolase  22.66 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  24.51 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  27.2 
 
 		 524 aa  68.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  25.1 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  24.4 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  22.62 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2039  hypothetical protein  24.64 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0439547  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  25.86 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  21.79 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_5097  predicted protein  25.1 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104643  normal  0.482624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1772  lysophospholipase-like protein  19.05 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 		 357 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  23.91 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3948  alpha/beta hydrolase fold  22.01 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  28.69 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  35.24 
 
 		 386 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0587  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  30 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2666  hypothetical protein  24.6 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  24.45 
 
 		 357 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2728  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43025  predicted protein  22.07 
 
 		 386 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0408918  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  21.99 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  29.82 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1057  lipase, class 2  30.51 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.24448  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2475  hypothetical protein  24.26 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  24.49 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  25 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  23.55 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2627  alpha/beta hydrolase  25.95 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37370  predicted protein  31.75 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.273183  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  23.32 
 
 		 301 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24510  hypothetical protein  23.84 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3858  biotin biosynthesis protein (BioH)  21.62 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4140  putative bioH protein  21.62 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3872  biotin biosynthesis protein (BioH)  21.62 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4338  biotin biosynthesis protein BioH  21.62 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  32.06 
 
 		 369 aa  42.7  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  28.26 
 
 		 223 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4025  bioH protein  21.62 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13624  hydrolase  27.54 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.907e-24  hitchhiker  0.00699432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  25 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 315 aa  42.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  23.91 
 
 		 206 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  32.29 
 
 		 217 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4250  putative bioH protein  22.05 
 
 		 246 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 294 aa  42  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>