46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4309 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  56.2 
 
 		 261 aa  322  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  55.17 
 
 		 261 aa  317  9e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  53.33 
 
 		 258 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  48.85 
 
 		 258 aa  278  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  43.82 
 
 		 266 aa  242  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  32.43 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  34.12 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  33.84 
 
 		 287 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2475  hypothetical protein  34.35 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2039  hypothetical protein  31.44 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0439547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  34.32 
 
 		 265 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  32.33 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2666  hypothetical protein  29.25 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  29.06 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  35.62 
 
 		 166 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  25.3 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7484  putative arylesterase-like protein  23.62 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  23.75 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  21.71 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  24.22 
 
 		 524 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  23.31 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3618  alpha/beta hydrolase fold protein  22.58 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1657  alpha/beta hydrolase fold  22.1 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  27.43 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5550  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5258  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 281 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5169  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 281 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3272  hypothetical protein  22.18 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  21.99 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43025  predicted protein  23.4 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0408918  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  26.4 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  28.74 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3206  hypothetical protein  36.54 
 
 		 61 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  30.53 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 		 295 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  25.12 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  22.61 
 
 		 263 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>