12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3206 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3206  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  123  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000165814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2039  hypothetical protein  73.08 
 
 
282 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0439547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  63.16 
 
 
287 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  43.75 
 
 
266 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  41.38 
 
 
253 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7484  putative arylesterase-like protein  46.94 
 
 
229 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  36.54 
 
 
261 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  37.5 
 
 
258 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  36.54 
 
 
261 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2666  hypothetical protein  44.68 
 
 
256 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357392  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  40 
 
 
257 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  41.67 
 
 
265 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>