78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1606 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  587  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2039  hypothetical protein  71.79 
 
 
282 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0439547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2475  hypothetical protein  59.55 
 
 
269 aa  318  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  75.15 
 
 
166 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  43.7 
 
 
266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  44.57 
 
 
265 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  36.54 
 
 
266 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  33.84 
 
 
261 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  35.98 
 
 
266 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  32.57 
 
 
261 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  34.73 
 
 
258 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  31.7 
 
 
257 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  30.19 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2666  hypothetical protein  32.44 
 
 
256 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357392  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  30.51 
 
 
253 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
294 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3206  hypothetical protein  63.16 
 
 
61 aa  79  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000165814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7484  putative arylesterase-like protein  38.32 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  24.36 
 
 
249 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  24.06 
 
 
524 aa  62.4  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  29.48 
 
 
260 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  25.86 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  36.26 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  31.58 
 
 
258 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  30 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 
271 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  32.63 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  20.69 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  26.17 
 
 
274 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
255 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
267 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  25.79 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  30.77 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  33.66 
 
 
283 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0060  putative esterase/lipase  32.08 
 
 
235 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1657  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 
290 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2097  hydrolase  32.48 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  33.03 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0478294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  30.59 
 
 
238 aa  45.8  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
315 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
277 aa  45.8  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  32.54 
 
 
498 aa  45.8  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  25.69 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  28.98 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  31.63 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  33.7 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  23.45 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  21.19 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  31.82 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 
349 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  20.22 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
277 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  27.27 
 
 
233 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 
273 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
294 aa  42.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  24.58 
 
 
330 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
255 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 
277 aa  42.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  28.23 
 
 
296 aa  42  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 
325 aa  42.4  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>