141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0841 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  94.87 
 
 
332 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  68.49 
 
 
309 aa  340  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  53.54 
 
 
289 aa  241  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  52.19 
 
 
261 aa  235  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  51.33 
 
 
257 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  49.79 
 
 
256 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  50.64 
 
 
256 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  53.07 
 
 
257 aa  224  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  50.87 
 
 
276 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  53.71 
 
 
257 aa  222  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  51.32 
 
 
276 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  51.32 
 
 
276 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  51.32 
 
 
276 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  48.43 
 
 
262 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  51.74 
 
 
250 aa  215  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  51.1 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  48.66 
 
 
255 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  49.55 
 
 
255 aa  208  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  51.07 
 
 
267 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  46.58 
 
 
260 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  47.39 
 
 
260 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  48.65 
 
 
259 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  49.55 
 
 
278 aa  206  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  48.2 
 
 
259 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  50.24 
 
 
256 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  43.56 
 
 
256 aa  205  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  43.04 
 
 
259 aa  204  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  47.7 
 
 
282 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  48.03 
 
 
252 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  46.69 
 
 
257 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  47.09 
 
 
257 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  46.84 
 
 
259 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  49.06 
 
 
256 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  46.72 
 
 
259 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  49.34 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  46.85 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  46.28 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  45.5 
 
 
265 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  49.29 
 
 
263 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  46.75 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  49.05 
 
 
263 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  48.57 
 
 
263 aa  188  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  49.05 
 
 
263 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  47.56 
 
 
263 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  47.11 
 
 
263 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  44.74 
 
 
226 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  43.5 
 
 
229 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  45.12 
 
 
264 aa  185  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  42.67 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  45.53 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  45.33 
 
 
238 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  43.97 
 
 
259 aa  182  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  45.33 
 
 
256 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  43.61 
 
 
230 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  43.42 
 
 
244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  40.79 
 
 
232 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  41.44 
 
 
231 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  43.81 
 
 
231 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  40.99 
 
 
230 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  40.87 
 
 
249 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  42.6 
 
 
231 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  42.79 
 
 
270 aa  168  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  42.74 
 
 
286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  42.42 
 
 
260 aa  165  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  41.53 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  42.54 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  40.98 
 
 
231 aa  158  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  37.61 
 
 
230 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  38.25 
 
 
236 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  39.74 
 
 
258 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  41.53 
 
 
279 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  42 
 
 
283 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  38.26 
 
 
257 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  37.22 
 
 
231 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  34.48 
 
 
234 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  41.67 
 
 
233 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 
258 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  35.39 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  40.91 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  36.16 
 
 
268 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  36.52 
 
 
234 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  38.86 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  37.83 
 
 
249 aa  126  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  37.28 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  37.5 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4871  hypothetical protein  42.57 
 
 
147 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3294  hypothetical protein  42.57 
 
 
147 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487481  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  38.5 
 
 
200 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  27.98 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  30.67 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  27.19 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
241 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  27.5 
 
 
245 aa  56.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  22.54 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  30.52 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  23.45 
 
 
235 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  24.75 
 
 
241 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>