39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1741 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  535  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  66.41 
 
 		 261 aa  378  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  66.41 
 
 		 261 aa  363  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  53.33 
 
 		 261 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  51.16 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  48.83 
 
 		 266 aa  265  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  36.51 
 
 		 266 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  34.73 
 
 		 287 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  32.82 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2039  hypothetical protein  31.03 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0439547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2475  hypothetical protein  31.8 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  31.56 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  30.15 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2666  hypothetical protein  31.52 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  32.52 
 
 		 166 aa  92.4  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7484  putative arylesterase-like protein  28.29 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 265 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  26.87 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  25.1 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  38.05 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  26.09 
 
 		 524 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  26.79 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43025  predicted protein  22.71 
 
 		 386 aa  52.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0408918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  23.31 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3272  hypothetical protein  25.87 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3502  hypothetical protein  25.1 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1657  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_5097  predicted protein  29.5 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104643  normal  0.482624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3206  hypothetical protein  37.5 
 
 		 61 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3618  alpha/beta hydrolase fold protein  25.12 
 
 		 296 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>