112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0578 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 294 aa  597  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  34.52 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  30 
 
 		 524 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  27.04 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  31.72 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  28.24 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2039  hypothetical protein  29.39 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0439547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 276 aa  89  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  28.63 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  25.19 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  25.18 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  29.66 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  27.8 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  24.63 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2475  hypothetical protein  27.31 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  24.81 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  24.62 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2666  hypothetical protein  32.55 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  27.31 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  28.22 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  28.22 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  28.22 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  32.14 
 
 		 166 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0661  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.8 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0368056  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  25.74 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  26.24 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0236  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0658  hypothetical protein  44.26 
 
 		 70 aa  53.5  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4750  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111436  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4836  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  35.71 
 
 		 344 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3618  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0849  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.02 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  35.65 
 
 		 258 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 272 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4701  putative hydrolase protein  23.53 
 
 		 280 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0255091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1772  lysophospholipase-like protein  20.24 
 
 		 222 aa  49.3  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1435  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 253 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.458489  normal  0.862062 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  40.62 
 
 		 387 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5136  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  26.69 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0340  putative esterase  32.94 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  30.23 
 
 		 200 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  30.23 
 
 		 200 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 248 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  36.61 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5351  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  25.56 
 
 		 279 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  37 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 522 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0276  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3452  hypothetical protein  22.13 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281711  normal  0.0529388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  34.34 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  27.66 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  38.54 
 
 		 387 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_5097  predicted protein  30.85 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104643  normal  0.482624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1657  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  27.47 
 
 		 2762 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 		 387 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  33.56 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  27.84 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  38.54 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  33.56 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>