More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2903 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
522 aa  1023    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2848  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3094  hypothetical protein  33.75 
 
 
274 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3097  hypothetical protein  33.75 
 
 
274 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4358  hypothetical protein  29.76 
 
 
274 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4750  hypothetical protein  31.22 
 
 
275 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2787  hypothetical protein  33.75 
 
 
274 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3078  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2827  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.440449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0511  hypothetical protein  30.56 
 
 
275 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2855  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4349  hypothetical protein  30.04 
 
 
275 aa  114  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3069  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2184  hypothetical protein  32.92 
 
 
274 aa  114  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  normal  0.203194 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4511  hypothetical protein  28.85 
 
 
275 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4864  hypothetical protein  28.85 
 
 
275 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4733  hypothetical protein  28.85 
 
 
275 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3063  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4726  hypothetical protein  28.85 
 
 
275 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3369  hypothetical protein  27.54 
 
 
279 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1880  hypothetical protein  27.54 
 
 
279 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3136  hypothetical protein  27.31 
 
 
279 aa  100  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.147015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3373  hypothetical protein  27.31 
 
 
279 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00104836  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3351  hypothetical protein  27.12 
 
 
279 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3075  hypothetical protein  26.69 
 
 
279 aa  97.8  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3149  hypothetical protein  27.31 
 
 
279 aa  97.8  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3044  hypothetical protein  27.31 
 
 
279 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3396  hypothetical protein  27.31 
 
 
279 aa  97.8  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.812003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3371  hypothetical protein  27.31 
 
 
279 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1761  hypothetical protein  29.53 
 
 
267 aa  93.2  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.828673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2127  hypothetical protein  27.31 
 
 
279 aa  91.3  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2380  hypothetical protein  24.88 
 
 
246 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
335 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2557  hypothetical protein  24.88 
 
 
246 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2570  hypothetical protein  24.88 
 
 
246 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000316056 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2337  hypothetical protein  24.88 
 
 
246 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000523507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2298  hydrolase  24.88 
 
 
246 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0219  YqjL  41.9 
 
 
145 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2559  hypothetical protein  24.44 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317158  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1055  hypothetical protein  26.13 
 
 
269 aa  76.6  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000188451  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1711  hypothetical protein  30.4 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  40.35 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  31.22 
 
 
305 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  33.96 
 
 
298 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  33.96 
 
 
310 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  33.64 
 
 
286 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  32.71 
 
 
295 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  33.64 
 
 
286 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  33.64 
 
 
286 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  32.71 
 
 
286 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1963  hypothetical protein  30.56 
 
 
264 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  38.79 
 
 
614 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  32.71 
 
 
278 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0899  hypothetical protein  41.58 
 
 
320 aa  64.7  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 
304 aa  64.3  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  31.78 
 
 
278 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1853  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
354 aa  63.9  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 
354 aa  63.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  40.52 
 
 
463 aa  63.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 
332 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 
454 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0263  hypothetical protein  32.69 
 
 
334 aa  62  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  34.45 
 
 
323 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 
369 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0448  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 
326 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.868263  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 
369 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 
369 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
298 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
339 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25500  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.84 
 
 
294 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  36.11 
 
 
310 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  30.36 
 
 
327 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0723  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
268 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3334  hypothetical protein  34.31 
 
 
278 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2495  alpha/beta fold family hydrolase  30.36 
 
 
327 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21121  hydrolase or acyltransferase  28.33 
 
 
297 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.556966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 
387 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  39.22 
 
 
387 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  36.11 
 
 
425 aa  57.4  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  32.71 
 
 
462 aa  57  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
362 aa  57  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 
282 aa  57  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  38.83 
 
 
387 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  24.39 
 
 
275 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  35.45 
 
 
279 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 
387 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
362 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 
267 aa  55.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
277 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.63 
 
 
282 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  33.05 
 
 
456 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
291 aa  54.3  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  41.12 
 
 
267 aa  53.9  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
265 aa  54.3  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 
264 aa  53.9  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
343 aa  54.3  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
294 aa  53.9  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>