184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1853 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1853  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 354 aa  714    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  60.13 
 
 		 311 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  53.69 
 
 		 354 aa  315  8e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  34.95 
 
 		 454 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  33.92 
 
 		 463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 		 330 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  33.54 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 		 454 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0448  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.868263  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  37.45 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0219  YqjL  35.16 
 
 		 145 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  40.37 
 
 		 614 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2380  hypothetical protein  34.21 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2298  hydrolase  34.21 
 
 		 246 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2557  hypothetical protein  34.21 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2337  hypothetical protein  34.21 
 
 		 246 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000523507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2570  hypothetical protein  34.21 
 
 		 246 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000316056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6083  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 		 326 aa  86.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2559  hypothetical protein  34.48 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317158  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1774  hypothetical protein  36.81 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  38.18 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  36.73 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2495  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0899  hypothetical protein  31.93 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0856  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  25.45 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3345  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  24.27 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  21.99 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  21.61 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  22.53 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  23.3 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  24.41 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  35.29 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  22.83 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  23.43 
 
 		 286 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  23.43 
 
 		 286 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31848  predicted protein  23.1 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00294  mitochondrial integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03090)  27.57 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  35.58 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3334  hypothetical protein  23.02 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25500  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.84 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257089  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2854  hypothetical protein  21.88 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3068  hypothetical protein  21.88 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2847  putative hydrolase  22.01 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391973  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0128  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2826  hypothetical protein  21.88 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0152162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2786  hypothetical protein  21.88 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2660  hypothetical protein  33.57 
 
 		 479 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.53 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  34.35 
 
 		 312 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7767  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 		 288 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21121  hydrolase or acyltransferase  25.52 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.556966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3136  hypothetical protein  22.04 
 
 		 328 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3018  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 329 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0766964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 		 341 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  23.93 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  29.66 
 
 		 258 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  27.03 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.18 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0723  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 268 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 504 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 		 249 aa  51.2  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  32.76 
 
 		 324 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 312 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  26.13 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  26.13 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.13 
 
 		 291 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  26.13 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.13 
 
 		 291 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  26.13 
 
 		 290 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  26.13 
 
 		 291 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  37.88 
 
 		 317 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  35.85 
 
 		 317 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  31.58 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  37.74 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  30.43 
 
 		 327 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>