297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1468 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 311 aa  625  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  58.58 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1853  alpha/beta hydrolase fold  60.13 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  36.24 
 
 		 463 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 335 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  37.37 
 
 		 454 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  31.17 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  33.02 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 454 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  36.51 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0219  YqjL  36.29 
 
 		 145 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  43.61 
 
 		 304 aa  99  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0448  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.868263  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6083  alpha/beta hydrolase fold protein  33.23 
 
 		 326 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2298  hydrolase  35.71 
 
 		 246 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2570  hypothetical protein  35.71 
 
 		 246 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000316056 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2337  hypothetical protein  35.71 
 
 		 246 aa  92.4  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000523507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2380  hypothetical protein  35.71 
 
 		 246 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2557  hypothetical protein  35.71 
 
 		 246 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603556  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  37.5 
 
 		 614 aa  89.4  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1774  hypothetical protein  34.38 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2559  hypothetical protein  35.71 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2495  alpha/beta fold family hydrolase  23.48 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  22.93 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0899  hypothetical protein  30.45 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  33.07 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  31.5 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31848  predicted protein  25 
 
 		 549 aa  76.6  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  32.48 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3345  alpha/beta hydrolase fold protein  40.68 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21121  hydrolase or acyltransferase  29.53 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.556966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  33.96 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  32.11 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  33.02 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  26.09 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  32.11 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  37.86 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  32.11 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  32.11 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  36.22 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.41 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0128  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0856  alpha/beta hydrolase fold protein  36.51 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  33.74 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3334  hypothetical protein  35.19 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 		 364 aa  59.3  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2826  hypothetical protein  24.04 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0152162  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  34.9 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  32.54 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  33.1 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2854  hypothetical protein  23.5 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3068  hypothetical protein  23.5 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25500  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.13 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 		 504 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2847  putative hydrolase  22.51 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2786  hypothetical protein  23.5 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  32.9 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 		 437 aa  55.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 364 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  29.34 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4576  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 474 aa  53.5  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 265 aa  53.5  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  22.82 
 
 		 310 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7767  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 		 288 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2660  hypothetical protein  30.77 
 
 		 479 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0723  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00294  mitochondrial integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03090)  27.31 
 
 		 522 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185522 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37880  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.57 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  34.03 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>