More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2553 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 354 aa  723    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  58.58 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1853  alpha/beta hydrolase fold  53.69 
 
 		 354 aa  315  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 		 463 aa  165  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  35.79 
 
 		 330 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  34.32 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 		 340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 454 aa  109  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0448  alpha/beta hydrolase fold protein  32.01 
 
 		 326 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.868263  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  45.3 
 
 		 614 aa  105  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0219  YqjL  38.46 
 
 		 145 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6083  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  41.22 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2380  hypothetical protein  32.82 
 
 		 246 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2557  hypothetical protein  32.82 
 
 		 246 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0899  hypothetical protein  29.87 
 
 		 320 aa  93.2  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2298  hydrolase  32.82 
 
 		 246 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2337  hypothetical protein  32.06 
 
 		 246 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000523507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2570  hypothetical protein  32.06 
 
 		 246 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000316056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2495  alpha/beta fold family hydrolase  33.73 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  32.93 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  35.47 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2559  hypothetical protein  31.82 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317158  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.81 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1774  hypothetical protein  31.51 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  23.05 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  34.87 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  37.06 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3345  alpha/beta hydrolase fold protein  40.32 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  36.19 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  25.6 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0128  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  24.64 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7767  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0856  alpha/beta hydrolase fold protein  36.72 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  37.59 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3136  hypothetical protein  26.58 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  34.42 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  34.88 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31848  predicted protein  27.72 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.55 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  31.55 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  31.61 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  27.78 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00294  mitochondrial integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03090)  29.35 
 
 		 522 aa  59.7  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185522 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  27.78 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21121  hydrolase or acyltransferase  28.38 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.556966 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  27.08 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  27.08 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  27.08 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  27.08 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  37.31 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  27.08 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  27.78 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.81 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  26.39 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 368 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3018  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0766964 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35370  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.98 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  32.43 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25500  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.66 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257089  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  28.36 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  28.36 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  27.61 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  27.61 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3334  hypothetical protein  34.78 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  28.36 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>