More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0414 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 454 aa  905    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  50.98 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  44.66 
 
 		 463 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1853  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 		 311 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  34.32 
 
 		 354 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  38.05 
 
 		 339 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  48.59 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  47.5 
 
 		 340 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 		 310 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  35.26 
 
 		 323 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  33.23 
 
 		 333 aa  91.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  37.4 
 
 		 293 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0448  alpha/beta hydrolase fold protein  33.92 
 
 		 326 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.868263  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.09 
 
 		 614 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0899  hypothetical protein  40.58 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0219  YqjL  36.36 
 
 		 145 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2495  alpha/beta fold family hydrolase  21.62 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0681  hypothetical protein  32 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  21.02 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00294  mitochondrial integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03090)  25.99 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  35.56 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1774  hypothetical protein  32.58 
 
 		 302 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.59 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 		 522 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2380  hypothetical protein  34.26 
 
 		 246 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2337  hypothetical protein  34.26 
 
 		 246 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000523507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2298  hydrolase  34.26 
 
 		 246 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2557  hypothetical protein  34.26 
 
 		 246 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2570  hypothetical protein  34.26 
 
 		 246 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000316056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2559  hypothetical protein  32.41 
 
 		 246 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6083  alpha/beta hydrolase fold protein  35.33 
 
 		 326 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0680  hypothetical protein  31.75 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3136  hypothetical protein  26.12 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37880  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.2 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2847  putative hydrolase  27.27 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2854  hypothetical protein  24.47 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25500  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.74 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257089  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3068  hypothetical protein  24.47 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31848  predicted protein  24.36 
 
 		 549 aa  63.5  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2826  hypothetical protein  26.87 
 
 		 328 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0152162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2786  hypothetical protein  27.07 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  30.09 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  39.64 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  40.68 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 581 aa  60.1  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 		 253 aa  59.7  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  38.32 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  30.19 
 
 		 278 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  37.6 
 
 		 278 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  30.97 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  33.93 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3510  hypothetical protein  23.53 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.875172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3345  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  30.19 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  33.33 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  31.13 
 
 		 286 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  39.82 
 
 		 280 aa  57  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 295 aa  57  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 290 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  30.28 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0679  hypothetical protein  29.37 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 309 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 362 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 312 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  32.04 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  30.19 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  32.04 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  30.19 
 
 		 286 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  32.04 
 
 		 327 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  32.04 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  37.84 
 
 		 282 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  35.66 
 
 		 514 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  32.04 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  30.19 
 
 		 286 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 257 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>