More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37880 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37880  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 		 314 aa  631  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  56.81 
 
 		 314 aa  320  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3136  hypothetical protein  50.49 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3510  hypothetical protein  35.96 
 
 		 329 aa  205  8e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.875172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  41.29 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3018  alpha/beta hydrolase fold protein  39.3 
 
 		 329 aa  165  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0766964 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0680  hypothetical protein  32.38 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0681  hypothetical protein  29.68 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0679  hypothetical protein  27.6 
 
 		 343 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2847  putative hydrolase  22.73 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2826  hypothetical protein  21.59 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0152162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2786  hypothetical protein  21.21 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2854  hypothetical protein  21.37 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3068  hypothetical protein  21.37 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  32.45 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 454 aa  62.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0614  hypothetical protein  37.23 
 
 		 121 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  32.17 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  31.15 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  27.73 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  26.75 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.74 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  26.75 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  26.75 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  26.89 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  30.33 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.75 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  30.33 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  30.33 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  30.81 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  26.11 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  30.33 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 283 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  26.11 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  26.45 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  24.84 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  24.84 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  24.84 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  24.84 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  24.84 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  24.84 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  25.48 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 354 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  29.82 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  25 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  26.23 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  23.9 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0219  YqjL  30.1 
 
 		 145 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 290 aa  53.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  28.65 
 
 		 367 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  24.36 
 
 		 287 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  29.79 
 
 		 278 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 329 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  28.72 
 
 		 278 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 		 270 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 351 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  28.07 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  24.68 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1667  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>