More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3547 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 463 aa  918    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 454 aa  276  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  45.1 
 
 		 454 aa  276  8e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  35.99 
 
 		 311 aa  166  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1853  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 354 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  46.11 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  49.66 
 
 		 330 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 		 332 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0448  alpha/beta hydrolase fold protein  39.73 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.868263  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  39.06 
 
 		 323 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  45.07 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0899  hypothetical protein  44.76 
 
 		 320 aa  96.7  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  40.83 
 
 		 614 aa  86.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1774  hypothetical protein  41.96 
 
 		 302 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  35.29 
 
 		 392 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  22.97 
 
 		 327 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0681  hypothetical protein  31.2 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  33.06 
 
 		 298 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  36.8 
 
 		 293 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  33.06 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0219  YqjL  36.54 
 
 		 145 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2495  alpha/beta fold family hydrolase  29.19 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00294  mitochondrial integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03090)  26.02 
 
 		 522 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.42 
 
 		 314 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 298 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37880  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.16 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2298  hydrolase  36.27 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2380  hypothetical protein  36.27 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2337  hypothetical protein  36.27 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000523507  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2557  hypothetical protein  36.27 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2570  hypothetical protein  36.27 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000316056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3345  alpha/beta hydrolase fold protein  31.89 
 
 		 262 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2559  hypothetical protein  34.86 
 
 		 246 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  33.91 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  32.17 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31848  predicted protein  24.74 
 
 		 549 aa  71.2  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  32.17 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  35.85 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  35.85 
 
 		 278 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3018  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 		 329 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0766964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21121  hydrolase or acyltransferase  30.23 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.556966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  39.71 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  39.71 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2854  hypothetical protein  30.53 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3068  hypothetical protein  30.53 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2847  putative hydrolase  29.77 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2786  hypothetical protein  30.53 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0723  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0679  hypothetical protein  30.95 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2826  hypothetical protein  30.53 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0152162  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  33.54 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0680  hypothetical protein  29.37 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3334  hypothetical protein  24.64 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  36.72 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  35.26 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25500  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.84 
 
 		 294 aa  63.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257089  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  40.52 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6083  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 270 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  35.71 
 
 		 314 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  26.9 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3136  hypothetical protein  23.95 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  23.56 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7767  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 		 271 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 		 253 aa  59.3  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0128  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  25.87 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  25.87 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  25.87 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  25.87 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  40.4 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  27.08 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  29.06 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>