82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6338 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 339 aa  676    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.67 
 
 		 614 aa  135  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  31.55 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 311 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  33.44 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  35.97 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1853  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  34.1 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 		 340 aa  96.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0448  alpha/beta hydrolase fold protein  28.48 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.868263  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0899  hypothetical protein  39.1 
 
 		 320 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  26.52 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  24.04 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  24.14 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00294  mitochondrial integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03090)  29.64 
 
 		 522 aa  82.8  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185522 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  25.09 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  24.73 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  24.73 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  26.99 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  24.36 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  24.38 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  23.16 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2559  hypothetical protein  25.17 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317158  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1774  hypothetical protein  34.27 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0219  YqjL  31.45 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2495  alpha/beta fold family hydrolase  22.07 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6083  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2298  hydrolase  23 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2570  hypothetical protein  22.67 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000316056 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2337  hypothetical protein  22.67 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000523507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0856  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25500  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.41 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257089  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2557  hypothetical protein  22.26 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2380  hypothetical protein  22.26 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0680  hypothetical protein  24.65 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0679  hypothetical protein  26.95 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31848  predicted protein  23.39 
 
 		 549 aa  57  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.99 
 
 		 314 aa  57  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0681  hypothetical protein  23.47 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0128  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 		 293 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2847  putative hydrolase  21.84 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391973  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  35.96 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2854  hypothetical protein  21.9 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3068  hypothetical protein  21.9 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2826  hypothetical protein  21.9 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0152162  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3334  hypothetical protein  21.07 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0803  hypothetical protein  28.99 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2786  hypothetical protein  21.43 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  28.49 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4576  hypothetical protein  29.32 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00390  DNA-directed RNA polymerase iii largest subunit, putative  29.59 
 
 		 1466 aa  46.6  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.297029  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  31.53 
 
 		 253 aa  46.2  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3018  alpha/beta hydrolase fold protein  34.72 
 
 		 329 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0766964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0723  alpha/beta hydrolase fold  20.46 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 275 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21121  hydrolase or acyltransferase  31.33 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.556966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 312 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 		 318 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 362 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0061  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 260 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>