More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 		 314 aa  626  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3136  hypothetical protein  50 
 
 		 328 aa  323  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37880  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  58.27 
 
 		 314 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3510  hypothetical protein  37.25 
 
 		 329 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.875172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  41.69 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3018  alpha/beta hydrolase fold protein  40.43 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0766964 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0680  hypothetical protein  31.14 
 
 		 339 aa  159  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0679  hypothetical protein  28.72 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0681  hypothetical protein  30.31 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2847  putative hydrolase  23.53 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2826  hypothetical protein  23.57 
 
 		 328 aa  92.4  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0152162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2854  hypothetical protein  25.1 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2786  hypothetical protein  22.7 
 
 		 328 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3068  hypothetical protein  25.1 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  22.54 
 
 		 310 aa  85.5  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  37.3 
 
 		 463 aa  76.3  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  27.48 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  34.96 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 332 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  27.48 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  28 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  33.85 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  34.62 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  31.79 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0614  hypothetical protein  32.18 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0448  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.868263  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.71 
 
 		 562 aa  59.3  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  34.97 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  24.4 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  26.51 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  30.51 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  23.81 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  23.81 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  23.81 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  23.81 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  22.42 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  23.67 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  21.82 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1762  alpha/beta fold family hydrolase  30.84 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  24.4 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  23.4 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  21.82 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 		 339 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  21.82 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  23.21 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  22.53 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1185  Alpha/beta hydrolase  34.21 
 
 		 281 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116011  normal  0.229286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  28.39 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  22.75 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  22.81 
 
 		 330 aa  53.1  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 229 aa  53.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  21.21 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 255 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  29.11 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  21.21 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>