More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1501 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
340 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  46.11 
 
 
463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  30.34 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 
354 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  28.28 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  36.88 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
335 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
298 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  28.14 
 
 
286 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  40.56 
 
 
330 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  27.16 
 
 
310 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  28.77 
 
 
278 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  28.42 
 
 
286 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  28.08 
 
 
286 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  28.08 
 
 
286 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
333 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  28.08 
 
 
295 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  28.42 
 
 
278 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1853  alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 
354 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  47.5 
 
 
454 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 
311 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  40.15 
 
 
323 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  44.35 
 
 
454 aa  99.4  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0448  alpha/beta hydrolase fold protein  39.84 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.868263  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0219  YqjL  37.59 
 
 
145 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2298  hydrolase  36.07 
 
 
246 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2337  hypothetical protein  35.25 
 
 
246 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000523507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2570  hypothetical protein  35.25 
 
 
246 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000316056 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2380  hypothetical protein  35.25 
 
 
246 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2557  hypothetical protein  35.25 
 
 
246 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2559  hypothetical protein  34.43 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317158  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  24.03 
 
 
614 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2495  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.7 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  25.41 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3136  hypothetical protein  31.48 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0899  hypothetical protein  40 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2854  hypothetical protein  28.48 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3068  hypothetical protein  28.48 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3345  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2826  hypothetical protein  28.48 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0152162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
522 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2786  hypothetical protein  28.03 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  24.84 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6083  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0679  hypothetical protein  30.66 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0680  hypothetical protein  32.28 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0681  hypothetical protein  26.06 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31848  predicted protein  23.79 
 
 
549 aa  65.9  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1774  hypothetical protein  30 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 
271 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3334  hypothetical protein  32.62 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2847  putative hydrolase  27.22 
 
 
328 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391973  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37880  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.71 
 
 
314 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3018  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0766964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 
256 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  34.03 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
431 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  24.27 
 
 
265 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21121  hydrolase or acyltransferase  35.63 
 
 
297 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.556966 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  25.95 
 
 
271 aa  60.5  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  24.64 
 
 
265 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
340 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 
321 aa  59.3  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 
331 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  32.14 
 
 
258 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  26.24 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3510  hypothetical protein  26.92 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.875172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0128  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0723  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
253 aa  56.2  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  21.2 
 
 
267 aa  56.2  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2660  hypothetical protein  28.32 
 
 
479 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25500  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.93 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  25.09 
 
 
264 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.47 
 
 
425 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  26.19 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7352  Alpha/beta hydrolase  29.5 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
262 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
362 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7767  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
294 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>