More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3345 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3345  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 262 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0856  alpha/beta hydrolase fold protein  42.7 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2660  hypothetical protein  37.88 
 
 		 479 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7767  alpha/beta hydrolase fold protein  37.91 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0110  alpha/beta hydrolase fold protein  35.13 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0905  hypothetical protein  39.57 
 
 		 191 aa  86.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.763043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1853  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0061  alpha/beta hydrolase fold protein  34.72 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0128  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  30.58 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  23.51 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  42.37 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  37.5 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  45.05 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  40.94 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  34.17 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  33.33 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  32.38 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1435  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.458489  normal  0.862062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  29.81 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  32.38 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  29.81 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1774  hypothetical protein  42.45 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  29.81 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  31.43 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  29.81 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2298  hydrolase  22.54 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2337  hypothetical protein  22.13 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000523507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2570  hypothetical protein  22.13 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000316056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35370  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.97 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  36.84 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3334  hypothetical protein  27.08 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0899  hypothetical protein  38.21 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2380  hypothetical protein  21.72 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0961  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2557  hypothetical protein  21.72 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603556  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  41.82 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  43.14 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  38.28 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  39.83 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  31.54 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  39.83 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.8 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4750  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  40.17 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4836  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  41.35 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  43.14 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  37.04 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  39.02 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5136  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  38.69 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2559  hypothetical protein  20.56 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0723  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2495  alpha/beta fold family hydrolase  28.7 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  31.07 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29.44 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5351  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0219  YqjL  30.77 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1108  Alpha/beta hydrolase  42.16 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024849  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  35.04 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 		 431 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0448  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.868263  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  37.43 
 
 		 320 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.77 
 
 		 372 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  33.88 
 
 		 363 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  37.96 
 
 		 321 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  36.36 
 
 		 294 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 352 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  30.16 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.62 
 
 		 390 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>