More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4836 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4750  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
263 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111436  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4836  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
263 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5136  alpha/beta hydrolase fold  96.96 
 
 
263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13624  hydrolase  76.98 
 
 
257 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.907e-24  hitchhiker  0.00699432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5351  alpha/beta hydrolase fold  75 
 
 
254 aa  388  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1435  alpha/beta hydrolase fold  72.33 
 
 
253 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.458489  normal  0.862062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0961  alpha/beta hydrolase fold protein  57.92 
 
 
284 aa  278  8e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0587  alpha/beta hydrolase fold protein  51.22 
 
 
258 aa  229  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35370  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.26 
 
 
261 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0341  alpha/beta hydrolase fold protein  44.76 
 
 
248 aa  158  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  33.47 
 
 
278 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.59 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.62 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2188  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  26.95 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.87 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  25.37 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  29.39 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.34 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  30.15 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
281 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
281 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
281 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5264  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
258 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  27.84 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1882  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0242391  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.6 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  26.21 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  27.67 
 
 
268 aa  59.3  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
284 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  25.37 
 
 
255 aa  58.9  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  26.56 
 
 
302 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  27.17 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
344 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  29.12 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.97 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  28.24 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  26.39 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  28.96 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  27.91 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  26.77 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  26.77 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  26.22 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  23.48 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 
229 aa  56.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  27.84 
 
 
257 aa  55.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
265 aa  55.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  26.77 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
252 aa  55.5  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  26.77 
 
 
254 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  26.77 
 
 
254 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 
264 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
263 aa  55.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  26.77 
 
 
254 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  26.77 
 
 
254 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  25.2 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
394 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4389  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3345  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.22 
 
 
367 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  27.91 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  27.91 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  20.39 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.95 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  25.9 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  25.2 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1517  alpha/beta hydrolase fold protein  23.58 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>