More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0110 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0110  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 308 aa  621  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0128  alpha/beta hydrolase fold protein  35.69 
 
 		 291 aa  132  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7767  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2660  hypothetical protein  31.7 
 
 		 479 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0856  alpha/beta hydrolase fold protein  36.12 
 
 		 298 aa  92.4  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3345  alpha/beta hydrolase fold protein  45.38 
 
 		 262 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  40.59 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  35.71 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  39.6 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.45 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  36.19 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  35.83 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  35.61 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  34.65 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1774  hypothetical protein  30.23 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.97 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6615  Alpha/beta hydrolase  36.07 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  29.75 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  32.38 
 
 		 264 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0975  alpha/beta fold family hydrolase  34.34 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1333  alpha/beta fold family hydrolase  34.34 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  28.8 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0316  alpha/beta fold family hydrolase  34.34 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271899  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  35.77 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  34.58 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0592  alpha/beta fold family hydrolase  34.34 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  28 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  32.77 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  32.65 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  35.24 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  29.7 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  29.7 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  29.7 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  29.7 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 265 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  34.96 
 
 		 270 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  32.26 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2497  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 317 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 328 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  30.69 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 317 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.33 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.03 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.57 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 258 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  29.7 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  31.08 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  29.7 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1310  alpha/beta fold family hydrolase  35.16 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0918705  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  29.1 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>