More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0128 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0128  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 291 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0110  alpha/beta hydrolase fold protein  35.69 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0856  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2660  hypothetical protein  35.84 
 
 		 479 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7767  alpha/beta hydrolase fold protein  41.09 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3345  alpha/beta hydrolase fold protein  42.97 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  37.12 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  38.17 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  39.52 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  34.78 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  34.03 
 
 		 454 aa  62.4  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  36.11 
 
 		 392 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  36.92 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  36.15 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  36.22 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  34.13 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  36.97 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.51 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  36.22 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0899  hypothetical protein  36.36 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  28.57 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 		 463 aa  58.9  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0905  hypothetical protein  33.85 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.763043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1774  hypothetical protein  41.12 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0448  alpha/beta hydrolase fold protein  32.05 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.868263  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  36.15 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  35.83 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1853  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  30.58 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  35.35 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  36.63 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  35.35 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1843  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00347923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  35.35 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  34.97 
 
 		 345 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  36.15 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  38.54 
 
 		 504 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  22.66 
 
 		 335 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  29.03 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5387  alpha/beta hydrolase  33.56 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  37.04 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.79 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  32.59 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 323 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 243 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  35.2 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>