More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5387 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5387  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 290 aa  568  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  42.75 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3471  alpha/beta hydrolase  36.19 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  35.9 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2686  alpha/beta hydrolase fold protein  38.62 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  41.73 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17930  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.01 
 
 		 330 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5013  carboxylesterase Na  34.41 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257907  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  39.72 
 
 		 408 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  37.58 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  26.54 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1006  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3473  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4023  alpha/beta hydrolase fold protein  35.61 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2694  alpha/beta fold family hydrolase  22.22 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00231525  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  39.1 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  36.72 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  29.93 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  33.04 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  33.04 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  33.04 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  33.04 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  33.04 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  33.04 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.17 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  33.04 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  41.12 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  33.04 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  32.17 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2549  lipase  25.19 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.14 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.04 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2776  lipase  25.19 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000301548 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.43 
 
 		 372 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  36.75 
 
 		 393 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.18 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  27.45 
 
 		 397 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0128  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 328 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  31.07 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  28.7 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.93 
 
 		 374 aa  53.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.21 
 
 		 370 aa  52.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 363 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.89 
 
 		 370 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  30.97 
 
 		 297 aa  52.8  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2389  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 277 aa  52.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0360603  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  26.67 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 346 aa  52.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  33.97 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.58 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.86 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  33.33 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  27.36 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  27.69 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  29.57 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  35.29 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  37.42 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  29.6 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  40.2 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  29.57 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>