More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0853 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 454 aa  883    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  50.98 
 
 		 454 aa  356  5e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  45.1 
 
 		 463 aa  294  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 		 311 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 		 339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  51.09 
 
 		 330 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 354 aa  126  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1853  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 354 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0448  alpha/beta hydrolase fold protein  29.04 
 
 		 326 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.868263  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 323 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  44.35 
 
 		 340 aa  106  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 332 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0899  hypothetical protein  39.39 
 
 		 320 aa  90.5  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 		 333 aa  87  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00294  mitochondrial integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03090)  24.62 
 
 		 522 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  38.1 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  36.23 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  30.64 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  32.1 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.59 
 
 		 614 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1774  hypothetical protein  32.21 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  28.48 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0219  YqjL  36.27 
 
 		 145 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0681  hypothetical protein  29.85 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37880  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.22 
 
 		 314 aa  66.6  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6083  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  30.51 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  36.8 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2495  alpha/beta fold family hydrolase  25.17 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  24.67 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  32.38 
 
 		 278 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  37.01 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0128  alpha/beta hydrolase fold protein  37.24 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 		 343 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2337  hypothetical protein  31.68 
 
 		 246 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000523507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2298  hydrolase  31.68 
 
 		 246 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.76 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  34 
 
 		 284 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2570  hypothetical protein  31.68 
 
 		 246 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000316056 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  35.83 
 
 		 284 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 		 284 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2380  hypothetical protein  32 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  31.43 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2557  hypothetical protein  32 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603556  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31848  predicted protein  23.17 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2559  hypothetical protein  31 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317158  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  38.33 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2786  hypothetical protein  21.53 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2847  putative hydrolase  22.26 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2854  hypothetical protein  20.91 
 
 		 330 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3068  hypothetical protein  20.91 
 
 		 330 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 287 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 309 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2826  hypothetical protein  21.53 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0152162  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  31.93 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  30.14 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  31.93 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  31.93 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3345  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  30.14 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  30.48 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  21.83 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  40.87 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  36.28 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  31.93 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.46 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3136  hypothetical protein  22.63 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  37.12 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  29.52 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  40.16 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  40.16 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 		 307 aa  57  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 301 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  29.52 
 
 		 286 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  32.76 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  33.87 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 		 320 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  34.95 
 
 		 253 aa  55.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 289 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 278 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 300 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 320 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>