261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4312 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
333 aa  623  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
340 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 
339 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
335 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
332 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  43.95 
 
 
463 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1853  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 
354 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2380  hypothetical protein  25.72 
 
 
246 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2337  hypothetical protein  25.72 
 
 
246 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000523507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2298  hydrolase  26.09 
 
 
246 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2557  hypothetical protein  25.72 
 
 
246 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2570  hypothetical protein  25.72 
 
 
246 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000316056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2559  hypothetical protein  23.79 
 
 
246 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
354 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0219  YqjL  43.4 
 
 
145 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  34.22 
 
 
330 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  25.71 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  25.64 
 
 
298 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  25.99 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  25.99 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 
298 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  25.83 
 
 
286 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  26.15 
 
 
295 aa  89.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 
286 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 
454 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  33.12 
 
 
454 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  24.44 
 
 
278 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 
323 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0448  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.868263  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  25.89 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  39.82 
 
 
614 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
522 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  54.05 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0899  hypothetical protein  37.71 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  28.4 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2826  hypothetical protein  32.23 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0152162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2854  hypothetical protein  31.4 
 
 
330 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3068  hypothetical protein  31.4 
 
 
330 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2786  hypothetical protein  31.4 
 
 
328 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6083  alpha/beta hydrolase fold protein  42.99 
 
 
326 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2847  putative hydrolase  30.58 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 
343 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  30.19 
 
 
350 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 
431 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.41 
 
 
321 aa  59.7  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3018  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 
329 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0766964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2495  alpha/beta fold family hydrolase  19.53 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0680  hypothetical protein  27.34 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1774  hypothetical protein  33.57 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 
289 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0679  hypothetical protein  26.43 
 
 
343 aa  56.6  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31848  predicted protein  22.79 
 
 
549 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  19.35 
 
 
327 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21121  hydrolase or acyltransferase  29.57 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.556966 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3510  hypothetical protein  20.71 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.875172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.41 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  33.62 
 
 
255 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07404  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01280)  28.15 
 
 
361 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0681  hypothetical protein  29 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3136  hypothetical protein  25.77 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  29.14 
 
 
194 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 
340 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 
256 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
362 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
295 aa  52.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  37.84 
 
 
278 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
309 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0856  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 
298 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3345  alpha/beta hydrolase fold protein  41.07 
 
 
262 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3334  hypothetical protein  34.58 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  24.68 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  32.82 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  20.63 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
253 aa  50.4  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0110  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
308 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25500  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.8 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
295 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  22.94 
 
 
291 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  29.61 
 
 
319 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 
437 aa  49.3  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 
298 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 
331 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1050  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
322 aa  49.7  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.173196  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
296 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37880  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.3 
 
 
314 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 
332 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 
287 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  33.33 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0378  alpha/beta fold family hydrolase  29.63 
 
 
244 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>