More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4655 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
305 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  52.3 
 
 
293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
335 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
330 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  24.04 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  24.21 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  24.54 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2559  hypothetical protein  26.11 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  24.16 
 
 
286 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  26.99 
 
 
339 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  25.48 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  23.95 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  23.95 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2337  hypothetical protein  25.45 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000523507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2298  hydrolase  25.45 
 
 
246 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2570  hypothetical protein  25.45 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000316056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  25.28 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2380  hypothetical protein  26.55 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2557  hypothetical protein  26.55 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  34.87 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  23.71 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  36.23 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 
463 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  31.22 
 
 
522 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0899  hypothetical protein  38.07 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  22.56 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  40.16 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 
331 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  35.43 
 
 
392 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 
291 aa  62.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  22.12 
 
 
310 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
343 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1853  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 
354 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  36.89 
 
 
304 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
504 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0723  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0219  YqjL  33.33 
 
 
145 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
331 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
297 aa  60.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  37.24 
 
 
345 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  33.84 
 
 
294 aa  58.9  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3345  alpha/beta hydrolase fold protein  39.02 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0681  hypothetical protein  28.48 
 
 
353 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  35.81 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  33.88 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  34.26 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31848  predicted protein  22.83 
 
 
549 aa  57.8  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  40.98 
 
 
364 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  40.5 
 
 
364 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  34.78 
 
 
261 aa  57  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1774  hypothetical protein  36.28 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  33.91 
 
 
271 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  27.32 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 
381 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
258 aa  55.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 
295 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 
291 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  33.93 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  42.22 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  39.05 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  25.9 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  35.43 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  25.29 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  34.97 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  35.05 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.09 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  normal  0.959468 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  28.1 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  34.86 
 
 
425 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 
389 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  25.29 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 
288 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.53 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  25.29 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 
282 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>