More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0961 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0961  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0587  alpha/beta hydrolase fold protein  65.32 
 
 		 258 aa  315  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1435  alpha/beta hydrolase fold  61.54 
 
 		 253 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.458489  normal  0.862062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4750  alpha/beta hydrolase fold  57.72 
 
 		 263 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111436  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4836  alpha/beta hydrolase fold  57.72 
 
 		 263 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5136  alpha/beta hydrolase fold  57.32 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13624  hydrolase  59.92 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.907e-24  hitchhiker  0.00699432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5351  alpha/beta hydrolase fold  59.51 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35370  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  51.38 
 
 		 261 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0341  alpha/beta hydrolase fold protein  44.22 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 281 aa  96.3  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 270 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.63 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4389  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2188  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.51 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.29 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  23.37 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  23.37 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.84 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  22.61 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  22.61 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  22.61 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  31.75 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  24.71 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  22.22 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  22.22 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  26.77 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  26.17 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.92 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  30.34 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  23.32 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  27.07 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  22.69 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  23.28 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  24.61 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  25.75 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1280  alpha/beta fold family hydrolase  25.81 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5264  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  26.59 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  25.91 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2449  alpha/beta fold family hydrolase  24.22 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00496811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2252  alpha/beta fold family hydrolase  24.72 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0246146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  26.4 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2417  alpha/beta fold family hydrolase  24.72 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.286524  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  24.39 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2435  hydrolase, alpha/beta fold family  24.72 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  25.51 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2516  hydrolase, alpha/beta fold family  25.39 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  23.74 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  25.2 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  23.46 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0343  alpha/beta fold family hydrolase  34.09 
 
 		 372 aa  57  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  21.15 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>