291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004031 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  100 
 
 		 275 aa  574  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01430  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  75.67 
 
 		 264 aa  427  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  55.51 
 
 		 263 aa  289  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  46.27 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  47.77 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  42.86 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1590  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  44.53 
 
 		 272 aa  205  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1784  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  44.53 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.359602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  44.62 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1483  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  44.13 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1112  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  45.04 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3202  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  44.81 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  41.86 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  39.76 
 
 		 252 aa  195  8.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  42.31 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2642  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  41.86 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0298629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  40.7 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  41.47 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  41.47 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  41.47 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  41.47 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  41.92 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  41.34 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  41.92 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  41.92 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2418  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  41.86 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.081901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2652  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  41.15 
 
 		 252 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  40.24 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  41.43 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  36.86 
 
 		 277 aa  148  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  35.07 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 264 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 		 256 aa  139  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 264 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 		 267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  34.51 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  36.18 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  38.43 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 		 267 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  32.52 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  28.24 
 
 		 274 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 		 307 aa  99.4  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.79 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.04 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.04 
 
 		 270 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.04 
 
 		 270 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.04 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  30.83 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  26.62 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  25.66 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  25.66 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1017  hypothetical protein  31.02 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  27.44 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  25.88 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  29.29 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.04 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  27.76 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.03 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14030  hypothetical protein  28.08 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  36.17 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  26.76 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  25.56 
 
 		 581 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  23.34 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.4 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 		 522 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>