203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2642 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2642  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  100 
 
 
252 aa  518  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0298629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  99.6 
 
 
252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  98.81 
 
 
252 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  98.81 
 
 
252 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  98.81 
 
 
252 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  98.41 
 
 
252 aa  510  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  98.41 
 
 
252 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  97.62 
 
 
252 aa  507  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2418  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  96.43 
 
 
252 aa  485  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.081901  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2652  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  75.79 
 
 
252 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00598559  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  75.79 
 
 
252 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  75.4 
 
 
252 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  75.79 
 
 
252 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  75.4 
 
 
252 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  66.27 
 
 
258 aa  338  5.9999999999999996e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  51.04 
 
 
263 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1483  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  52.3 
 
 
272 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1590  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  51.88 
 
 
272 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1784  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  51.88 
 
 
272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.359602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  49.19 
 
 
256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1112  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  51.33 
 
 
274 aa  221  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  46.31 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3202  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  48.32 
 
 
266 aa  215  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01430  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  44.22 
 
 
264 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  41.86 
 
 
275 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  39.76 
 
 
252 aa  189  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  43.53 
 
 
263 aa  185  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  41.95 
 
 
264 aa  175  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  44.89 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 
265 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 
261 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 
259 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  37.24 
 
 
260 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 
267 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  38.7 
 
 
277 aa  138  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  35.16 
 
 
266 aa  135  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  37.34 
 
 
265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
267 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 
267 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
264 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 
264 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  34.23 
 
 
264 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
264 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
267 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  30.92 
 
 
274 aa  122  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 
267 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  29.84 
 
 
265 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 
277 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
277 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
270 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 
269 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 
269 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
270 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  31.06 
 
 
267 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
262 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  34.15 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
277 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  32.94 
 
 
307 aa  91.3  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  29.48 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
250 aa  89.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  26.59 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
270 aa  82  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  27.08 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  27.08 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.23 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  26.67 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  26.67 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.67 
 
 
270 aa  79  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
270 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.67 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  30.64 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.23 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  30.17 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  27.08 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1017  hypothetical protein  31.25 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
306 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14030  hypothetical protein  29.28 
 
 
337 aa  59.3  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.12 
 
 
443 aa  59.3  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  24.75 
 
 
262 aa  55.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1626  thioesterase, menaquinone synthesis protein  29.75 
 
 
278 aa  52.8  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.833654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
271 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  35.29 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>