More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0351 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 265 aa  554  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  41.5 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  39.92 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  42.75 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  41.43 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.12 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01430  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  39.53 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  38.52 
 
 		 252 aa  161  9e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.74 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.01 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.15 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  34.78 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.5 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  36.76 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  36.76 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  36.76 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.76 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.06 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.15 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2642  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.01 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0298629  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.69 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.69 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1590  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.86 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1483  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.86 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.29 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.29 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1784  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.86 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.359602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2418  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.94 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.081901  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  37.79 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3202  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.55 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1112  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.14 
 
 		 274 aa  151  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.97 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2652  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.29 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  34.96 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  35.91 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  35.52 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  37.2 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 267 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  33.71 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 283 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  30.2 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  28.83 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  27.82 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 250 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 280 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 270 aa  95.9  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 268 aa  95.5  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  27.34 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  27.34 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  27.34 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  27.34 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.95 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.95 
 
 		 270 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  27.1 
 
 		 271 aa  89.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  28.08 
 
 		 266 aa  89  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  28.51 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  26.91 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.73 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.02 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  26.54 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.95 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14030  hypothetical protein  29.86 
 
 		 337 aa  75.5  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  29.63 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  29.63 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  29.63 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  25.97 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  28.24 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0492  alpha/beta hydrolase fold  23.16 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>