More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0281 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  45.69 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  46.24 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  46.24 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  46.24 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  45.05 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  42.42 
 
 		 259 aa  222  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  44.98 
 
 		 264 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  45.22 
 
 		 264 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  44.53 
 
 		 266 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  44.85 
 
 		 264 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  43.61 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  45.69 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  38.35 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  34.63 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.19 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2652  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.8 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.8 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.8 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.41 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.47 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  37.2 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.05 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.94 
 
 		 252 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  36.8 
 
 		 256 aa  143  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.81 
 
 		 252 aa  142  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.55 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2642  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.94 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0298629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  32.55 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  32.55 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  32.55 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.16 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.36 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2418  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.16 
 
 		 252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.081901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  37.4 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.6 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.86 
 
 		 255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1590  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.34 
 
 		 272 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01430  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.4 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1112  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.33 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1784  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.34 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.359602 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1483  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  34.94 
 
 		 272 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3202  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.2 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.82 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  35.12 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  29.84 
 
 		 270 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  28.68 
 
 		 270 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  28.68 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  29.46 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 		 283 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  28.24 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  28.24 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  29.96 
 
 		 274 aa  108  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  30.12 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  27.86 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  27.86 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  28.69 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  28.24 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  30.31 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  27.71 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  27.45 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14030  hypothetical protein  34.27 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  25.49 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  29.01 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  34.15 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  34.15 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  33.33 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  33.33 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  34.15 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  40.78 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  34.15 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  24.57 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>