More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2165 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
255 aa  525  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  41.53 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  36.59 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  34.29 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 
279 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3250  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
247 aa  122  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
262 aa  106  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  26.69 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.82 
 
 
443 aa  85.5  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  35.34 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  25.58 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
274 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
274 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.74 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.23 
 
 
263 aa  79  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  24.23 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  24.52 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  24.52 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  24.52 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  24.52 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  25.13 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  24.19 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  24.52 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  27.95 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  23.25 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.34 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  25.49 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.42 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  23.9 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  28.3 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  24.1 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  23.97 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  22.51 
 
 
456 aa  72  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  25.48 
 
 
271 aa  72  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  25.2 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  23.6 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.19 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  22.88 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  25.86 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.42 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  26.1 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.29 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  33.63 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.53 
 
 
367 aa  68.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  27.49 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.62 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  25.1 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  24.7 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  25.79 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.9 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  26.32 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  25.1 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.9 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  26.32 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  21.85 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  26 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  23.68 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  22.22 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  23.97 
 
 
425 aa  66.2  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.81 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>