More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3250 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3250  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 247 aa  519  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  45.58 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  38.37 
 
 		 279 aa  187  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  33.06 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  26.21 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  26.11 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  29.49 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.33 
 
 		 283 aa  86.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.69 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  24.59 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  22.41 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  24.68 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  22.31 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  22.51 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  21.54 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  22.78 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  23.98 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  23.5 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  27.96 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.54 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  24.47 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  24.14 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  23.43 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  23.91 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  21.22 
 
 		 425 aa  65.5  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  21.62 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  24.49 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  22.31 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2368  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  22.31 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  20.82 
 
 		 259 aa  62  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.365456  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  22.82 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  21.9 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  22.27 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  24.5 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  22.04 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  24.08 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  24.69 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  24.08 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  23.67 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  24.5 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1108  alpha/beta hydrolase fold  22.45 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  24.5 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  22.22 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  22.22 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  20.7 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 		 341 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  23.17 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  20.16 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  21.79 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  23.33 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  21.14 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  22.45 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  24.12 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  21.93 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  23.14 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2245  3-oxoadipate enol-lactonase  23.48 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  20.66 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  21.32 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  34.52 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0592  alpha/beta fold family hydrolase  24.87 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  19.84 
 
 		 387 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>