More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3108 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 248 aa  464  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  46.25 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 		 254 aa  180  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  49.16 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  41.32 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  46.05 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  47.5 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  38.25 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  39.92 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  41.22 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 		 265 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  41.22 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  35.46 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.56 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  41.54 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  29.84 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  35.89 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  40.17 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  39.33 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  38.37 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  36.36 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.19 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 262 aa  119  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  36.24 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  36.86 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  35.15 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  31.68 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  33.46 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 		 279 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  32.18 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 261 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  35.63 
 
 		 233 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  30.92 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  37.71 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  30.08 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  30.1 
 
 		 239 aa  85.5  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.92 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  32.08 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  36.71 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  28.15 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 352 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  34 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  30.53 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.53 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.53 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  30.53 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3250  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  32.56 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  39.57 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  32.76 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.32 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  36.14 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  34.45 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  31.43 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4362  alpha/beta hydrolase fold protein  32.39 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  30.8 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  36.46 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1467  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1449  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>