85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3452 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3452  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281711  normal  0.0529388 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  37.28 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  26.6 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  20.78 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  25.21 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  24.51 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  22.13 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  25.11 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.33 
 
 		 645 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1379  protein of unknown function UPF0227  22.54 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.33 
 
 		 645 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.33 
 
 		 645 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  25 
 
 		 645 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.74 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  23.39 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  21.94 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  27.56 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  22.44 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  25.34 
 
 		 273 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  24.04 
 
 		 252 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  26.55 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  21.65 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  20.66 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  24.8 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  23.38 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  20.87 
 
 		 634 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  24.29 
 
 		 330 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  20.87 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  20.87 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4250  putative bioH protein  26.74 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 273 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  23.18 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.66 
 
 		 645 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0132  protein of unknown function UPF0227  22.93 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.440551  hitchhiker  0.0000000954344 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  21.08 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  24 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  20.42 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  30 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1354  hypothetical protein  25.53 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.341852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  30.12 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  25.2 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3872  biotin biosynthesis protein (BioH)  25 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4025  bioH protein  25 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3858  biotin biosynthesis protein (BioH)  25 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4140  putative bioH protein  25 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4338  biotin biosynthesis protein BioH  25 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  23.5 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2781  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  26.56 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  20.55 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  24.32 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2243  hypothetical protein  24.58 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  22.78 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  24.6 
 
 		 420 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  22.17 
 
 		 408 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  20.72 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  22.43 
 
 		 278 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  22.43 
 
 		 278 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  22.43 
 
 		 278 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  22.43 
 
 		 278 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  22.95 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  29.91 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 311 aa  42.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1349  hypothetical protein  23.64 
 
 		 228 aa  42.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.108709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  27.55 
 
 		 280 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  23.58 
 
 		 324 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.66 
 
 		 299 aa  42  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  34.48 
 
 		 278 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0776  protein of unknown function UPF0227  21.56 
 
 		 213 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>