More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04550 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  100 
 
 
290 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  50.76 
 
 
294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  44.29 
 
 
305 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  37.88 
 
 
292 aa  205  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  41.44 
 
 
305 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  32.95 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  29.29 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  30.9 
 
 
312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  27.64 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.96 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  31.05 
 
 
345 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  25.94 
 
 
319 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  25.52 
 
 
319 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  25.73 
 
 
319 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  26.36 
 
 
319 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  29.33 
 
 
309 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  26.64 
 
 
320 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  25.1 
 
 
300 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  24.37 
 
 
319 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  32.16 
 
 
284 aa  99  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  32.55 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.45 
 
 
314 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  32.68 
 
 
284 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  32.16 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  32.16 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  32.16 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  32.16 
 
 
284 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  32.16 
 
 
284 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  24.8 
 
 
317 aa  95.9  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  25.94 
 
 
313 aa  95.9  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  25.2 
 
 
337 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  31.76 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  24.9 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  24.9 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  24.9 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  24.9 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  24.9 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  24.9 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  23.67 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  26.03 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  24.08 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  25.69 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0109  alpha/beta fold family hydrolase  23.36 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000692138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  24.49 
 
 
307 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  25.4 
 
 
308 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  24.08 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0108  hypothetical protein  24.54 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000248564  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  27.02 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  25.81 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  28.98 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  25.58 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
314 aa  87.4  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  25.93 
 
 
309 aa  87  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  27.69 
 
 
314 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  28.92 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  33.68 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  27.73 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  35.6 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  30.05 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  36.11 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  30.16 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  31.13 
 
 
326 aa  79  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  26.1 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  23.61 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0588  putative alpha/beta superfamily hydrolase  28.69 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.123084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  25.78 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  25.77 
 
 
282 aa  77  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2612  hypothetical protein  21.12 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0809624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2298  hypothetical protein  20.32 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4715  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  27.89 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  29.62 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  29.26 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8252  hypothetical protein  34.63 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2435  putative hydrolase  32.38 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0653999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  26.17 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.8 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  31.6 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  31.58 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  24.64 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0659  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  31.42 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.44 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl390  hydrolase  21.59 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0649986  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14054  predicted protein  26.02 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0384  hypothetical protein  21.69 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  27.08 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.74 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0215  hydrolase of the alpha/beta superfamily  21.69 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000127658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  28.21 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  29.91 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  31.41 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.37 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  23.91 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.46 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  24.19 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  25 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  29.31 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2823  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  29.89 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  hitchhiker  0.0000422692 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  28.74 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>