More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1762 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 260 aa  536  1e-151  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  48.78 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  36.65 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  36.36 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  33.19 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  31.3 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  33.63 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  31.13 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.87 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  30 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  28.52 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  28.44 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  26.75 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  28.16 
 
 		 269 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  31.78 
 
 		 402 aa  72  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  24.89 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  26.63 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  27.68 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  27.31 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  28.63 
 
 		 412 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  25.78 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  25.69 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  25.2 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  23.77 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  27.03 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  27.03 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  28.7 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  27.05 
 
 		 409 aa  62.4  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  24.53 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  24.54 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  32.08 
 
 		 276 aa  62  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  32.08 
 
 		 276 aa  62  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  26.58 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  30.08 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  24.09 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  25.1 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  25.34 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  30.48 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  25.1 
 
 		 423 aa  59.3  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  25.34 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  36.08 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  25.68 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  29.17 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  26.7 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  29.32 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  24.7 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  24.28 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  22.73 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  23.77 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  28.37 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  22.75 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  20.83 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  25.68 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  29.41 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  24.54 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  22.81 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  26.75 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0135  protein of unknown function UPF0227  24.89 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  28.02 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  25.23 
 
 		 338 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0132  protein of unknown function UPF0227  25.65 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.440551  hitchhiker  0.0000000954344 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  25.09 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  23.89 
 
 		 485 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  28.12 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0998  hypothetical protein  25.27 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  31.45 
 
 		 406 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  27 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  30.66 
 
 		 580 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  37.33 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  32.46 
 
 		 397 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  32.52 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 319 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  34.18 
 
 		 668 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0508  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  28.51 
 
 		 348 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  22.41 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  29.06 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  29.53 
 
 		 252 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41254  predicted protein  30.91 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.401564  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  28.42 
 
 		 271 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  28.64 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  25.79 
 
 		 408 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  22.96 
 
 		 324 aa  52.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2227  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  41.67 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  24.38 
 
 		 407 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 320 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  24.35 
 
 		 406 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  25.12 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  25.45 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>