116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03205 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  100 
 
 
281 aa  580  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3452  hypothetical protein  37.28 
 
 
273 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281711  normal  0.0529388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  23.9 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  27.36 
 
 
405 aa  66.2  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  24.43 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.81 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  23.17 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  23.27 
 
 
259 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  26.92 
 
 
316 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  27.18 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  27.33 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  23.68 
 
 
290 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  31.75 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  25.43 
 
 
413 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  25.11 
 
 
252 aa  57  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  25.42 
 
 
408 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  22.81 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  24.11 
 
 
255 aa  56.2  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  22.73 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  25.11 
 
 
415 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
295 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  23.75 
 
 
409 aa  52.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  23.91 
 
 
385 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
297 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  22.56 
 
 
412 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  25.52 
 
 
292 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  22.08 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  28.47 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  29.37 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  25.73 
 
 
410 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  22.37 
 
 
402 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  26.49 
 
 
360 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  22.5 
 
 
269 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.99 
 
 
273 aa  49.7  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  23.89 
 
 
257 aa  49.3  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  27.5 
 
 
318 aa  48.9  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2300  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  23.14 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000887585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.22 
 
 
645 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4903  hypothetical protein  30.94 
 
 
372 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  25.66 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  24.18 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  24.89 
 
 
251 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.35 
 
 
645 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  23.41 
 
 
255 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  25.62 
 
 
274 aa  47  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  26.12 
 
 
292 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.74 
 
 
1094 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  24.5 
 
 
360 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  22.33 
 
 
397 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2781  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  26.49 
 
 
264 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  24.25 
 
 
273 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  22.22 
 
 
256 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  21.96 
 
 
258 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.18 
 
 
644 aa  45.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  31.65 
 
 
295 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  24.34 
 
 
274 aa  46.2  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  24.63 
 
 
266 aa  45.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.78 
 
 
645 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  24.36 
 
 
1010 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  26.87 
 
 
405 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  23.21 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  23.26 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  20.85 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  26.52 
 
 
408 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.35 
 
 
645 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  26.54 
 
 
868 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2202  dienelactone hydrolase  22.08 
 
 
528 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.413126  decreased coverage  0.0031404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  23.49 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  30.6 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  26.42 
 
 
409 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  25.36 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  24.22 
 
 
423 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  23.3 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  29.25 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2193  hypothetical protein  22.95 
 
 
674 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.9 
 
 
634 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  24.35 
 
 
645 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  23.64 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1349  hypothetical protein  23.74 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.108709  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  24 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  22.84 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  25 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  22.07 
 
 
386 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  24.03 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  23.75 
 
 
214 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_93787  predicted protein  27.42 
 
 
346 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770884  normal  0.222874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  24.49 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  23.08 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  27.34 
 
 
299 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  24.84 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  20.81 
 
 
681 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>