226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0594 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 305 aa  613  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  56.66 
 
 		 306 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  55.82 
 
 		 306 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  53.95 
 
 		 315 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  53.9 
 
 		 295 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  52.54 
 
 		 295 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  47.12 
 
 		 316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  46.02 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  51.19 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  40.34 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  42.19 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  42.27 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  42.81 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  39.59 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  41.67 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  38.1 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  40.8 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  35.97 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  35.97 
 
 		 313 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  35.97 
 
 		 313 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  34.97 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  35.55 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  34.64 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  32.06 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  44.93 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  33.67 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  32.45 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  29.58 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  31.52 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  43.48 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  32.52 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  31.99 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  30.88 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  29.11 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  27.05 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  27.05 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  27.82 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  31.51 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  29.35 
 
 		 467 aa  75.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  35.46 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  35.46 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  29.2 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  33.59 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  28.67 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  29.55 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  26 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  29.29 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  30.46 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  32.03 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  32.23 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  30.52 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  29.8 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  29.8 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  21.54 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  24.67 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  28.7 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  37.19 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  24.52 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  24.84 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  26.67 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  28.48 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  28.48 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  30.56 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  28.48 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  28.48 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  27.83 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  28.48 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  26.67 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  31.3 
 
 		 868 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  28.48 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  24.52 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  27.41 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  23.72 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  38.21 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  27.73 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  30.77 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  33.7 
 
 		 132 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  26.67 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  29.53 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  26.67 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  25.62 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  31.71 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  33.06 
 
 		 876 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  25.12 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  31.67 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  26.42 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  31.58 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  27.59 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  32.87 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  30.83 
 
 		 359 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  28.57 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  29.1 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  31.39 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  25.19 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  28.57 
 
 		 279 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>