208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2929 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  100 
 
 
237 aa  493  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  82.08 
 
 
306 aa  296  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  81.5 
 
 
306 aa  295  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  81.5 
 
 
306 aa  295  4e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  81.5 
 
 
306 aa  293  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  80.92 
 
 
306 aa  291  7e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  80.35 
 
 
310 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  80.35 
 
 
306 aa  290  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  80.35 
 
 
310 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  80.35 
 
 
306 aa  290  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  76.57 
 
 
304 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  76.57 
 
 
304 aa  265  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  63.37 
 
 
312 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  61.14 
 
 
301 aa  221  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  56.57 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  41.62 
 
 
305 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  40.61 
 
 
305 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  43.07 
 
 
305 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  40.61 
 
 
305 aa  164  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  45.09 
 
 
302 aa  161  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  46.78 
 
 
346 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  46.2 
 
 
320 aa  154  9e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2928  hypothetical protein  56.52 
 
 
322 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  45.5 
 
 
310 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  45.61 
 
 
330 aa  148  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1824  hypothetical protein  43.5 
 
 
310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7269  alpha/beta fold family hydrolase  42.5 
 
 
306 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  50 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0326  hypothetical protein  45.5 
 
 
306 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  43.9 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0346  hypothetical protein  45.5 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13117  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  50.34 
 
 
311 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  42.35 
 
 
337 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  46.26 
 
 
329 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  53.62 
 
 
305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  44.74 
 
 
336 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.66 
 
 
346 aa  138  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  52.71 
 
 
307 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  44.44 
 
 
342 aa  138  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  41.28 
 
 
342 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  40.59 
 
 
356 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  50 
 
 
310 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  38.57 
 
 
321 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  42.11 
 
 
342 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  44.67 
 
 
342 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1060  hypothetical protein  48.98 
 
 
308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.711691  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  41.18 
 
 
355 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  49.66 
 
 
307 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  40.12 
 
 
320 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  39.88 
 
 
360 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  42.57 
 
 
355 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3245  hypothetical protein  45.68 
 
 
328 aa  131  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  49.66 
 
 
307 aa  131  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  39.31 
 
 
360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  40.23 
 
 
368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  39.29 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  37.68 
 
 
345 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  44.25 
 
 
366 aa  128  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  40.23 
 
 
362 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  39.29 
 
 
342 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  40.49 
 
 
372 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  39.29 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  38.15 
 
 
358 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3213  hypothetical protein  43.83 
 
 
352 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  40.78 
 
 
347 aa  124  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  43.18 
 
 
378 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3911  hypothetical protein  47.02 
 
 
367 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0552429  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  38.29 
 
 
305 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  42.61 
 
 
378 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  40.8 
 
 
368 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  41.98 
 
 
363 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  42.05 
 
 
378 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  41.98 
 
 
363 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2082  hypothetical protein  41.98 
 
 
329 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0227342  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  43.48 
 
 
377 aa  121  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  42 
 
 
355 aa  122  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  38.37 
 
 
367 aa  121  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  37.36 
 
 
359 aa  121  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  47.86 
 
 
357 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  39.66 
 
 
364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  37.21 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  41.78 
 
 
354 aa  118  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  43.7 
 
 
345 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  40.91 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  41.33 
 
 
333 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  44.51 
 
 
359 aa  108  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  43.24 
 
 
327 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  37.36 
 
 
365 aa  106  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03774  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16580)  42.28 
 
 
237 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61538  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  34.78 
 
 
451 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  36.96 
 
 
319 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  41.51 
 
 
326 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1319  hypothetical protein  34.35 
 
 
316 aa  78.6  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.668778  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  40.52 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  33.58 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  35.38 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  36.07 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  36.89 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>