198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0206 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  100 
 
 		 342 aa  708    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  77.49 
 
 		 342 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  77.49 
 
 		 342 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  80.37 
 
 		 356 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  76.32 
 
 		 342 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  76.63 
 
 		 360 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  76.33 
 
 		 360 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  75.54 
 
 		 351 aa  538  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  74.85 
 
 		 336 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  75.07 
 
 		 345 aa  538  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  77.71 
 
 		 355 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  73.89 
 
 		 337 aa  528  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  77.26 
 
 		 321 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  74.93 
 
 		 354 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  71.93 
 
 		 342 aa  517  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  73.29 
 
 		 355 aa  502  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  70.22 
 
 		 355 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  74.34 
 
 		 305 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  49.52 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  49.21 
 
 		 330 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  49.37 
 
 		 346 aa  318  9e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  49.06 
 
 		 320 aa  316  3e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  48.41 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  48.91 
 
 		 329 aa  309  4e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  46.86 
 
 		 318 aa  298  9e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  49.52 
 
 		 362 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  48.88 
 
 		 320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  50.16 
 
 		 347 aa  285  8e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  46.98 
 
 		 372 aa  284  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  48.26 
 
 		 368 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  46.65 
 
 		 367 aa  279  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  46.01 
 
 		 358 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  47.3 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  46.67 
 
 		 368 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  44.44 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  42.94 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  46.03 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  42.01 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  44.35 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03774  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16580)  55.23 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  42.99 
 
 		 378 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  40.06 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  43.56 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  43.99 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  40.42 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  44.06 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  40.91 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  37.7 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  36.56 
 
 		 305 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  34.6 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  36.25 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  36.56 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  36.48 
 
 		 305 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  33.55 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  33.55 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  34.14 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  33.55 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  33.98 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  33.23 
 
 		 306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  32.9 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  32.9 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  32.9 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  32.9 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  35.14 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3213  hypothetical protein  33.8 
 
 		 352 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3245  hypothetical protein  35.21 
 
 		 328 aa  159  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  34.02 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  34.5 
 
 		 363 aa  156  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  34.5 
 
 		 363 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  35.24 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2082  hypothetical protein  35.26 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0227342  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  32.9 
 
 		 345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.64 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  35.47 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  34.9 
 
 		 366 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3911  hypothetical protein  36.09 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0552429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0346  hypothetical protein  33.54 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  33.66 
 
 		 377 aa  139  8.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  39.88 
 
 		 237 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0326  hypothetical protein  33.54 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7269  alpha/beta fold family hydrolase  32.06 
 
 		 306 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1824  hypothetical protein  32.71 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1060  hypothetical protein  34.21 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.711691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  37.79 
 
 		 307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  35.56 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  37.46 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2928  hypothetical protein  30.97 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  30.55 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  29.78 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  28.72 
 
 		 451 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  30.42 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  30.29 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  29.61 
 
 		 301 aa  96.3  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  26.79 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  42.2 
 
 		 132 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  29.15 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  29.97 
 
 		 307 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  27.46 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  28.87 
 
 		 299 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  26.3 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>