231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5227 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  85.02 
 
 		 316 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  67.55 
 
 		 314 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  42.19 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  39.24 
 
 		 295 aa  211  9e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  42.96 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  39.8 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  40.2 
 
 		 315 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  40.21 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  36.82 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  36.82 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  43.33 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  37.76 
 
 		 316 aa  192  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  36.3 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  35.92 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  37.55 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  36.09 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  36.09 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  36.09 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  33.44 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  33.68 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  31.86 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  29.19 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  30.67 
 
 		 309 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  32.55 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  30.56 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  30.67 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  32.2 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  36.81 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  33.44 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  31.8 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  40.41 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  45.76 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  34.1 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  26.33 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  26.33 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  27.65 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  28.9 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  29.45 
 
 		 467 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  37.4 
 
 		 451 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  25.5 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  30 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  25.97 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  29.85 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  33.87 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  31.93 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  28.03 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  28.79 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  29.69 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  30.3 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  30.58 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  29.55 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  29.55 
 
 		 355 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  30 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  34.19 
 
 		 132 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  28 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  30.83 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  29.58 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  28.35 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  31.37 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  30.61 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  26.98 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  31.37 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  30.39 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  25.52 
 
 		 340 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  28.63 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  26.19 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  32.79 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  26.19 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  31.37 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  32.35 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  33.59 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  29.55 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  31.3 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  28.7 
 
 		 237 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  30.39 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  28.35 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  30.39 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  30.08 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  30.65 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  26.19 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  27.2 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  34.62 
 
 		 876 aa  63.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  34.38 
 
 		 866 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1319  hypothetical protein  29.46 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.668778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  30.65 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  32.54 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  28.33 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  32.28 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  26.56 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  25.61 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  31.45 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  28.43 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>