261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6845 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  93.46 
 
 
306 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  59.57 
 
 
315 aa  342  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  54.95 
 
 
295 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  54.27 
 
 
295 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  56.66 
 
 
305 aa  325  8.000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  50.5 
 
 
316 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  43.34 
 
 
295 aa  257  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  50.5 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  44.9 
 
 
296 aa  229  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  43.34 
 
 
295 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  42.32 
 
 
308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 
297 aa  212  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  41.81 
 
 
318 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  40.99 
 
 
314 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  38.44 
 
 
316 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  40.35 
 
 
315 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  38.7 
 
 
295 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  38.7 
 
 
295 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  37.13 
 
 
321 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  39.27 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 
313 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  34.98 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 
302 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  36.27 
 
 
298 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  36.39 
 
 
317 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  36.01 
 
 
298 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  46.85 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  33.8 
 
 
299 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  34.98 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  33.33 
 
 
292 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  29.67 
 
 
297 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  32.35 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  31 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  32.63 
 
 
304 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  33.33 
 
 
307 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  29.11 
 
 
309 aa  119  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  28.87 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  28.87 
 
 
286 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  28.17 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  37.5 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  30.43 
 
 
467 aa  82.4  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  26.67 
 
 
269 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  34.35 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  26.91 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  33.33 
 
 
451 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  32.12 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  30.34 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  33.65 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  28.8 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  27.81 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  29.6 
 
 
342 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  27.73 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  28.89 
 
 
342 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  34.35 
 
 
876 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  31.2 
 
 
336 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  28 
 
 
360 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  28.99 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  29.08 
 
 
345 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  29.6 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  29.6 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 
305 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  35.11 
 
 
866 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  28.24 
 
 
337 aa  59.7  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  34.17 
 
 
278 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  28.8 
 
 
342 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  28.57 
 
 
304 aa  59.3  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  30.25 
 
 
368 aa  59.3  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  25.09 
 
 
292 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  25.09 
 
 
292 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  25.09 
 
 
292 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  30.25 
 
 
355 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  29.63 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  27.91 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  24.15 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  27.91 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  35.48 
 
 
377 aa  57.4  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  30.17 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  30.33 
 
 
359 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  31.3 
 
 
868 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  30.33 
 
 
378 aa  55.8  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  27.13 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  27.13 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  27.13 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  35.37 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  27.13 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  26.4 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  27.13 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  34.34 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  25.31 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  28.79 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  28.79 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  28.57 
 
 
355 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  28.57 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001536  hydrolases of the alpha/beta superfamily  31.3 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>